اختير المعهد القومى للتغذية عام 1992 كمركز معاون لمنظمة الصحة العالمية فى مجال الأبحاث والتدريب وبذلك أصبح ضمن المراكز الثمانية والعشرين المعاونة لمنظمة الصحة العالمية على المستوى العالمى ، وفى مايو 2006 حصل المعهد على شهادة الأيزو 9001 - 2000.

          من أبرز الأسباب لحرص إدارة المعهد للحصول على شهادة الجودة أن المنافسة بين المراكز البحثية التى تقوم بفحص الأغذية أصبحت شديدة فكان لابد من حصولنا على هذه الشهادة لتؤهلنا للمنافسة محلياً وعالمياً، ولقد عملنا من خلال خطة منظمة بدأت فى مارس 2004 باتصالنا بالهيئة العامة للمستشفيات والمعاهد التعليمية التابعة لوزارة الصحة والسكان للاستفادة من تجربتهم السابقة ثم استعنا بشركة أمريكية لها فرع بمصر لتقوم بعملية التقييم وإعادة التأهيل وكانت الزيارة الاستكشافية التى قام بها مندوب الشركة أول خطوة للتعرف على النظام القائم وتلتها مرحلة الإعداد بعقد جلسات مع العاملين بكافة الأقسام وكتابة تصور لطبيعة العمل بطريقة مقننة. و من أبرز النتائج العملية لإعادة الهيكلة إنشاء وحدة هندسية تختص بأجهزة المعامل لحصرها وصيانتها ومعايرتها تبعاً لمعايير الجودة العالمية.

         و يتم تقييم الأداء كل 6 أشهر للتأكد من أن كافة أقسام المعهد متماشية مع متطلبات الجودة حتى تتمكن من تدارك الأخطاء خاصة أن الشهادة يعاد منحها كل 3 سنوات. و بعد شهادة الجودة فى الإدارة نسعى للحصول على شهادة الأيزو الخاصة بالمعامل و الحصول على الاعتماد الخاص بالمنشآت الصحي

         ويحرص المعهد على طبع نشرات عن الجودة وعقد لقاءات مع كافة العاملين ورؤساء الأقسام لإيجاد حوار دائم بينهم حول الجودة .

                                                                                                                     د/ عزة عمر لطفى
                                                                                                                        رئيس وحدة توكيد الجودة
                                                                                                                        إستشارى باثولوجيا إكلينيكية

تتعهــــد الإدارة العليا للمعهد وجميع العاملين به برفع شعار " غذاء صحــي وآمــن لكل مواطن "  والعمل علي الارتقاء بالمستوي الصحي و التغذوي للمواطنين وعلي خفض معدلات سوء التغذية والأمراض المزمنة المتعلقة بالغذاء .
 كما تتعهد بالتزامها والتزام جميع العاملين بالمعهد بإرضاء العملاء المترددين سواء من المرضي أو المتعاملين معها من الجهات والمؤسسات المحلية والأجنبية أو منتجي المستحضرات الغذائية وغيرهم .
ويتعهد المعهد أن يتم ذلك عن طريق الالتزام بالتحسين المستمر لنظام الجودة المطبق بالمعهد وتحقيق متطلبات المواصفة القياسية الدولية ISO 9001 -2000 من أجل تحقيق الأهداف التي أنشئ من أجلها المعهد ألا وهي :-
   أولاً  :     إجراء البحوث الميدانية والتطبيقية والترصد التغذوي تبعاً للمتطلبات والمشاكل الصحية .
   ثانياً  :      التشخيص المبكر لأمراض سوء التغذية وعلاجها عن طريق العيادات الخارجية بالمعهد .
   ثالثاً  :      تقديم خدمة التثقيف الغذائي للمواطنين علي مستوي الجمهورية .
  رابعاً  :      تنمية مهارات الكوادر البشرية والارتقاء بمستوي العاملين في التغذية والباحثين وذلك بتقديم الخدمات التدريبية المتعلقة بالغذاء والتغذية
                 للقطاعات  المختلفة من المجتمع وللدارسين والأجانب .       
 خامساً :      تقديم الخدمات الاستشارية لمختلف الجهات والهيئات والأفراد والمتعلقة بالغذاء والتغذية .
 سادساً :      إجراء التحليلات المعملية للأغذية الخاصة قبل إجازتها للتداول طبقاً للمواصفة القياسية الصادرة من هيئة المواصفات والجودة .